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  • 《临床和实验医学杂志》2008年第3期摘录:临床和实验医学杂志2008弃3

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临床和实验医学杂志2008弃3月第7卷第3期·13·室间隔缺损患者外周血细胞因子基因表达状况的研究蒋立虹’王萍。李亚雄’陈智豫。叶筱玲。孟明耀。任永富。侯宗柳。。(1昆明市延安医院昆明医学院附属延安医院心胸外科;2昆明医学生物学实验中心云南昆明650051;3昆明云大生化技术有限公司云南昆明650106)【摘要】目的利用基因芯片技术,比较室间隔缺损病人和健康人外周血单个核细胞的细胞因子基因表达差异,从整体上认识室间隔缺损患者的细胞因子表达状况。方法通过检测102例室间隔缺损(VSD)患者外周血常规,并从中选择3例血小板平均体积不同数值的室间隔缺损的病人,另选5例健康人,应用总核糖核酸(RNA)的提取法(Trizol法)分别提取他们的外周血总RNA,逆转录合成cDNA,用Cy5、Cy3分别标记病人、健康人的eDNA,混合后在细因子基因谱芯片上杂交,经对原始数据的标准化和SAM芯片数据软件的应用,获得表达有显著性差异的细胞因子基因。结果在102例VSD患者中,73例血小板平均体积低于正常值,占71.57%,3例血小板平均体积不同数值的患者均表现为27种细胞因子基因表达下调,一种细胞因子基因表达上调。其中p胸腺素一4和核糖体蛋白s5基因在三个样本中均表达下调.我们对各自基因的作用进行分析,了解可能的分子机制。结论分析室间隔缺损病人外周血细胞因子的基因表达图谱,B胸腺素一4和核糖体蛋白s5基因可能在心室发育中共同起重要的作用。【关键词】室间隔缺损细胞因子基因芯片技术基因表达谱Geneexpressionprof'deofcytokinesinperipheralbloodofpatientswithventricularseptaldefect.JIANGLi—hong,WANGPiRg,LIYA一Ⅳiong.et0z.Dep口rtmentofCardiac—thoraxSurgery,Yan'anHospitalAffiliatedtoKunmingMedicalCollege,KunmingYunnan650051,China·【Abstract】ObjectiveByusinggenechiptechniquetocomparethegeneexpressionprofilebetweenpefipher~bloodofpatientswithisolatedven【ricularsep山defeetandheahhvcontrols,wegotarelativewholeviewoftherelationshipbetweenventricularseptaldefectandcytokines.Methods102DatientswithVSDweretestedforperipheralbloodanalysis.ThreeVSDpatientswithdifferentmeanplateletvolume(MPV)valueswereselectedfbrstudv.T0talamount0fRNAwasextractedfromperipheralbloodofthreeVSDpatientsandfivehealthyvolunteersbyTrizolmeth-0d.thentheRNAwassynthesizedtocDNAanddirectlyincorporatedwithfluorescentnucleotideCy3一dUTPforcontrolgrouporCy5一dUTPforVSDoatients.TwokindsofcDNAweremixedandhybridizedoncytokinegenechip.Afternormalization,differentialgeneexpressionwasassessedbvsignificanceanalysisofmicroatrays(SAM).ResultsAmong102VSDpatients,themeanplateletvolumeof73(71.57%)patientswasbelowtheaveragelevel.Th。geneexpressionshowedthat27kindsofcytokinegenesexpressedinperipheralbloodofthreeisolatedVSDpatientsweredown—regulatedincludingThymosin—beta一4andRibosomalproteins5.Functionsofthesegeneswereanalyzedandpossiblemechanismwasfound0utbvus.ConclusionAbove—mentionedfindingsdemonstratedthatThymosin—beta一4andRibosomalproteinS5mayplayanimportantroleindevelopmentofventricutarseptum.【Keywords】Ventricularseptaldefect;Cytokine;Genechiptechnology;Geneexpressionprofile先天性心脏病(congenitalheartdisease,CHD),是先天畸形中最常见的一种,约占活产新生儿的7%0~8‰。赖小今等…对2356例先心病相关因素构成比进行流行病学分析,室间隔缺损、房间隔缺损、动脉导管未闭的检出率位居前三位,分别为31.49%、20.20%和12.0l%。由于室间隔缺损属于多基因遗传性疾病,其发生率与家族遗传和导致发育畸变的罹患因素有关,从受精卵发育第18d到第7周,如果导致发育畸变的罹患因素一旦起作用,就会产生各种心血管畸形。为了解室间隔缺损(VSD)可能的发病机制和缺氧对机体免疫系统的影响,我们检测了102例VSD患者外周血,发现71.57%血小板平均体积低于正常值。并选择其中3例,利用基因芯片技术的大规模、高通量、高效率及并行性等特点旧。,使用细胞因子表达谱芯片检测VSD病人外周血细胞因子表达状况,对该病的相关致病基因进行筛选,试图探索VSD引起的机体损伤的分子免疫机制。基金项目:云南省昆明市科技计划项目(编号:昆科计字04S06012—01号)‘通讯作者:E—mail:hzl579@163.com1资料与方法1.1一般资料经手术确诊单纯性室间隔缺损102例,术前进行血常规等检测,从中选择血小板平均体积低于正常值的3例,(血小板平均体积为6.1fL,6.3fL和8.6fL各1例)行细胞因子芯片检测;对照组选取相同年龄,全部经临床及彩色多普勒超声心动图检查证实无心脏疾病的健康人5例,其中男性3例,女性2例。病人组和对照组均于术前清晨各自采集等量肝素抗凝外周血,并把对照组5例血等量混合,立即冻存于一70℃。表1102例VSD病例血小板平均体积和红细胞平均血红蛋白浓度对照表注:’正常值。1.2RNA提取及荧光探针标记对3例室间隔缺损病人的各自外周血及5例健康人混合血,用Trizol法(美国MRCTeagentBD)提取总RNA。鉴定RNA完整性及质量后,分别取30¨gRNA行逆转录荧光标记,即Cy3一dUTP(Amershampharmaeiabio—

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